एनआईईआर: ऑटोमेटा मुख्य कहानी मिशनों के बीच व्यापक अन्वेषण और साइड-क्वेस्ट पूरा करने की अनुमति देता है। गेम की अधिकांश सामग्री पहली बार खेलने पर छूटने योग्य लग सकती है। पहली बार क्रेडिट देखने के बाद भी, गेम अभी पूरा नहीं हुआ है। सभी पक्षीय खोजों तक पहुँचने के लिए खेल को पूरी तरह से ख़त्म करना आवश्यक है। इसे प्राप्त करने के लिए अध्याय चयन को अनलॉक और उपयोग करने का तरीका यहां बताया गया है।
इस खंड में वास्तविक अंत के संबंध में छोटी-मोटी बातें शामिल हैं।
चैप्टर सेलेक्ट को अनलॉक करने के लिए गेम के वास्तविक अंत में से एक को पूरा करना आवश्यक है। इसमें सभी तीन प्लेथ्रू को समाप्त करना और तीसरे प्लेथ्रू के अंतिम टकराव के दौरान एक विशिष्ट अंत का चयन करना शामिल है। जबकि प्लेथ्रूज़ के रूप में संदर्भित किया जाता है, कई लोग व्यापक कथा में प्रत्येक को एक अलग अध्याय मानते हैं।
प्लेथ्रू के क्रेडिट देखने के बाद, अपने गेम को सेव करें और एक अलग कैरेक्टर के रूप में खेलते हुए, अगले सेक्शन को शुरू करने के लिए उस सेव फ़ाइल को पुनः लोड करें। अंतिम प्लेथ्रू में कई वर्ण परिवर्तन शामिल होते हैं, और इसके पूरा होने से उस सेव फ़ाइल के लिए चैप्टर सेलेक्ट अनलॉक हो जाता है।
एक्सेस चैप्टर दो स्थानों से चुनें:
यह मेनू हथियार, स्तर और वस्तुओं सहित सभी प्रगति को बनाए रखते हुए, लोड करने के लिए किसी भी अध्याय का चयन करने की अनुमति देता है। कई बजाने योग्य पात्रों के साथ एक अध्याय लोड करते समय, आप चुन सकते हैं कि किस पात्र को खेलना है।
ध्यान दें कि चुने गए अध्याय की परवाह किए बिना, पूर्ण किए गए साइड क्वेस्ट को दोबारा नहीं चलाया जा सकता है। प्रगति को संरक्षित करने के लिए अध्यायों के बीच संक्रमण से पहले हमेशा एक एक्सेस प्वाइंट पर सेव करें; अन्यथा, स्तरों और वस्तुओं में कोई भी लाभ खो जाएगा। सभी सामग्री को पूरा करने और हर संभव अंत प्राप्त करने के लिए विकल्पों पर दोबारा गौर करने के लिए अध्याय चयन अमूल्य है।